检查时，病人端坐，头颈部不要偏扭，以免一侧颈椎横突向咽后壁隆起，造成脓肿假象。病人张口平静呼吸，舌自然伏于口底。在光源投照下，检查者左手托着患者下颌，右手持压舌板，将压舌板远端放在舌前2/3与后1/3交界处，不能太深，以免诱发恶心呕吐，压舌时不可用力过大，以免引起舌的抵抗。须轻轻向下、向后压下，然后依次观察口咽各处粘膜的色泽，有无充血、肿胀、溃疡、伪膜、斑疹、异物或新生物等。嘱病人发“啊—啊”声，注意软腭活动情况。如一侧软腭瘫痪，患侧软腭不能上举，且被牵向健侧;两侧瘫痪时，则软腭及悬壅垂均不能上举，说话呈开放性鼻音。
其次观察腭扁桃体的颜色、大小，表面是否光滑，有无伪膜及角化物，小窝内有无分泌物栓塞，舌腭弓及咽腭弓是否正常。可以咽腭弓为界，记扁桃体大小分度，凡扁桃体不超过咽腭弓者为Ⅰ°，超出于咽腭弓者为Ⅱ°，扁桃体接近中线者为Ⅲ°。还可用压舌板压迫舌腭弓处，有时可见稠厚分泌物从扁桃体上窝或小窝口挤出。
检查咽后壁粘膜有无充血、淋巴滤泡增生，粘膜是否发干，有无脓液及脓痂附着，两咽腭弓之后有无条索状的淋巴组织增生。
如发现软腭或咽壁隆起，应用手指触诊、穿刺吸引或X线拍片检查，以排除脓肿或肿瘤。如发现软腭、咽腭弓、舌腭弓或悬壅垂缺损及有疤痕粘连，应查明其原因。对一侧咽痛原因不明者，应用手指触查扁桃体处，以排除是否患有茎突综合征。
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