手术治疗适应于原发于扁桃体弓的较小肿瘤;扁桃体窝癌未扩展至周围组织或扩展范围较小者，可先行手术切除再行放疗。放疗失败或无效患者手术切除可作为补救治疗。
中期(T2～T3) 接受足量放射治疗后的局部失败率为30%;放疗5000Gy后，局部再采用手术救治者，其生存率无明显差异。
晚期(T3～T4) 大剂量放射治疗能控制大部分患者的病情。如果扁桃体肿瘤由于向外侵犯到下颌骨而定为T4应考虑手术治疗;或手术切除肿瘤并整复缺损，术后放射治疗巩固疗效。
